Die Mucicarmin-Färbung ist für die Anfärbung von Mucin bestimmt. Muzin ist ein Sekret, das von einer Vielzahl von Epithelzellen und Bindegewebszellen produziert wird. Bei bestimmten Darmentzündungen oder Karzinomen wird von den Epithelzellen ein Überschuss an Muzin abgesondert.

Die Mucicarmin-Färbetechnik ist auch nützlich, um den Ort eines Primärtumors zu bestimmen, indem Mucin produzierende Tumorzellen in einem Bereich sichtbar gemacht werden, der keine Mucin produzierenden Zellen enthält, was bedeutet, dass der Tumor in diesem Bereich nicht betroffen ist.

Die Mucicarmin-Färbung eignet sich auch zum Anfärben von eingekapselten Pilzen wie Kryptokokken.

Das Prinzip der Mucicarminfärbung beruht auf dem Vorhandensein von Aluminium, das mit Karmin einen Chelatkomplex bildet. Dadurch ändert sich die Ladung des Karminmoleküls in eine positive Ladung, wodurch es sich an saure Substrate mit geringer Dichte, wie z. B. Muzine, binden kann.